El Servei d'Anatomia Patològica dirigit pel Dr. Francesc Alameda realitza diverses tècniques diagnòstiques per a confirmació histològica dels preparats. Entre d'altres, s'utilitzen anticossos inmunorreactivos i tincions histoquímiques per al diagnòstic de la displàsia cortical focal (FCD), esclerosi de l'hipocamp i el diagnòstic diferencial dels tumors cerebrals relacionats amb epilèpsia.